作为重庆市药品监督管理局直属单位，重庆医药科技学校自1964年建校以来始终坚持规范办学。学校持有重庆市教育委员会核发的中等职业学历教育，所有开设专业均通过教育主管部门备案审批，严格执行国家职业教育标准。
两江新校区规划建设32间智能教室与18个标准化实验室，其中药品检测实验室配备高效液相色谱仪（HPLC）、气相色谱仪（GC）等精密仪器。特别建设的模拟药房实训室可完整还原药品零售场景，帮助学生掌握实际工作流程。
教学团队由61名专业教师构成，其中正高级职称1人、副高级职称3人，6人具有硕士以上学位。多位教师参与国家规划教材编写，主编的《有机合成制药工艺学》被多所院校选为指定教材。定期选派教师到辉瑞、太极等企业进行技术研修，保持教学内容与行业前沿同步。
与西南药业、科瑞制药等20余家企业建立人才定向培养机制，毕业生可胜任药品生产、质量检测、医药代表等岗位，近年毕业生专业对口率达87%以上。
学生可通过"3+2"中高职贯通培养项目进入重庆医药高等专科学校深造，或参加高职分类考试升入全日制本科院校。学校与沈阳药科大学合作开展继续教育项目，构建完整学历晋升体系。
学校建立三级教学质量监控机制，每周进行教学督导巡查，每月开展学生评教活动。所有专业课程设置企业实践环节，要求学生在校期间完成至少240课时的岗位实训，确保理论教学与实践能力同步提升。
